Vetenskap

Ett avföringsprov upptäcker 90 procent av tjocktarmscancerfallen utan koloskopi

Peter Finch

Världens näst dödligaste cancer kan nu upptäckas med ett avföringsprov och en algoritm. Forskare vid Genèves universitet har utvecklat ett test som identifierar 90 procent av fallen av kolorektal cancer — utan koloskopi, utan sedering och utan sjukhusbesök. Metoden fungerar genom att läsa dolda signaler i tarmbakterierna med en precision som inget diagnostiskt verktyg tidigare uppnått.

Kolorektal cancer dödar över 900 000 människor om året globalt. Vid tidig upptäckt överstiger överlevnadsgraden 90 procent. Problemet har alltid varit koloskopin — dyr, obehaglig och med en förberedelse som kräver en hel dag, vilket leder miljoner människor världen över att skjuta upp sin screening. Den fördröjningen är ofta skillnaden mellan en behandlingsbar diagnos och en terminal.

Tarmbakterierna kartlagda ner till subspeciesnivå

Genèveteamet angrep problemet från en helt annan vinkel. I stället för att direkt undersöka tjocktarmen kartlade de tarmmikrobiomet med en detaljnivå som ingen tidigare försökt — ner till subspecies för varje bakteriestam. Olika subspecies av samma bakterie kan ha helt motsatta effekter: vissa främjar tumörtillväxt, andra är neutrala. Tidigare tester som bara analyserade på artsnivå missade signalen helt.

En maskininlärningsmodell tränad på denna bakteriekatalog på subspeciesnivå läser ett standardprov av avföring och förutsäger förekomsten av kolorektal cancer med 90 procents noggrannhet. Koloskopin når 94 procent. Alla befintliga icke-invasiva metoder hamnar under båda — de bästa nuvarande alternativen når 70 till 80 procent.

Klinisk prövning förbereds med Genèves universitetssjukhus

En klinisk prövning i samarbete med Genèves universitetssjukhus förbereds för att fastställa vilka cancerstadier och lesionstyper metoden upptäcker mest effektivt. Om resultaten bekräftar modellens noggrannhet i olika populationer kan testet bli ett förstalinjes screeningverktyg — med koloskopi reserverad enbart för patienter med positivt utfall. Studien publicerades i Cell Host & Microbe.

Diskussion

Det finns 0 kommentarer.